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火山图的每个基因的 p 值就是从两组之间差异的一个特殊检验而来，只不过会在得到 p 值之后，一般会进行一个 Benjamini-Hochberg 方法校正多组的 p 值，得到 FDR（火山图的 Y 轴值）。
F D R = F P F P + T P = 1 P P V False discovery rate (FDR) 的真正的意思是“所有发现中发生了错误所占的比率”，也就是在计算所有的discovery中false (假发现)所占的比率。 FDR常被人逐字翻译为“错误发现率”，这个翻译容易导致误解，个人认为译为“误报率”更好。
我们在生物数据统计分析中，经常会听到p-value,adjusted p-value,q-value以及False discovery rate（FDR）。比如最常见实验组和对照组的差异基因表达分析，除了获得一个p值（p-value）,通常而言还会得到一个adjusted p-value或者FDR（false discovery rate）。那么他们之间到底有什么关系，为什么已经有了一个p-value来指征 ...
10 thg 3, 2018 · Recently I started getting calls from an outfit called Financial Debt Recovery Ltd. (FDR for short) in Richmond Hill, Ontario. The person leaving
BH FDR作为经典频率主义假设检验的拓展，是现代大规模假设检验的常用准则。 第一次接触BH FDR这样的放大运算的人，常常不知其所以然，这是很令人崩溃的。 这里最大的疑惑是，为什么要凭空引入q值。 这种放大矫正后的p值到底有什么实际意义呢？
所以另一个思路是相比于控制FWER, 我们改为控制FDR (False Discovery Rate)。 那啥是FDR呢，现在假设我们要进行N次假设检验，在这N个检验中，有 N_0 组数据是阴性（即Null Hypothesis是ground truth），其余 N_1=N-N_0 组数据为阳性。
17 thg 2, 2017 · 1.什么是FDR校正？ FDR（False Discovery Rate，假发现率）矫正是一种用于多重假设检验的统计方法。 在进行大量的假设检验时，存在许多可能的假阳性结果（错误拒绝原假设），这可能导致对发现真实效应的过高估计。
FDR GSEA 默认提供所有的分析结果，并且设定 FDR<0.25 为可信的富集，最可能获得有功能研究价值的结果。 但如果样品数目少，而且选择了 gene_set 作为 Permumation type 则需要使用更为严格的标准，比如 FDR<0.05。 Leading-edge分析
在对表达谱结果进行GSEA分析时，我看文献大多列出的是ES、p值和FDR。 那么，对于GSEA分析的结果，要求p值和FDR均小于0.05才能发表文章么？
9 thg 9, 2018 · 今天小编给大家带来的是索尼fdr-ax700使用教程，希望能帮助到大家！
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